Origine et dynamique de l'infection par le VIH-1 de sous-type CRF02_AG en Algérie
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Date
2021
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Publisher
UNIVERSITE MOHAMED BOUDIAF - M’SILA
Abstract
L’objectif de ce mémoire est d’étudier l’origine géographique et la dynamique de l’évolution de l’infection par le VIH-1, sous-type CRF02_AG en Algérie. 34 séquences CFR02_AG du VIH-1 env du gp120 de l'Algérie, ont été obtenues à partir de la base de données VIH de Los Alamos. Toutes les séquences du CRF02_AG env gp120 du VIH-1 en Algérie ont été utilisées pour l'analyse de l'origine géographique et 34 séquences du CRF02_AG env gp120 avec une année d'échantillonnage connue (de 2000 à 2003) ont été utilisées pour déterminer l'origine de l'infection par le VIH en Algérie. L’analyse phylogénétique des séquences env du VIH-1 a été utilisée pour rechercher l’origine géographique et le tMRCA du CRF02_AG algérien du VIH-1, y compris les profils d’évolution et les profils de croissance démographique du CRF02_AG algérien, en utilisant une approche bayésienne basée sur la coalescence modèles d'horloge.
L’analyse phylogénique des souches identifiées a montré que le sous-type CRF02_AG est prédominant, alors que les sous-types non- CRF02_AG représentent une grande diversité qui provienne principalement de l’Afrique subsaharienne, probablement par le biais de l’immigration et par l’activité d'échange entre les différentes populations.
Description
Keywords
Origine et dynamique de l'infection par le VIH-1 de sous-type CRF02_AG en Algérie