Identification de mutations ponctuelles dans des gènes par l’approche PCR-électrophorèse
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Date
2020-09
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
UNIVERSITE MOHAMED BOUDIAF - M’SILA
Abstract
Au dépit des conditions sanitaires qui régies dans le monde dû à la propagation de la pandémie de COVI-19, en particulier en Algérie, certaines manipulations n’ont pas été accomplies dans la partie pratique de ce travail. Pour ce, nous avons contenté de l’interprétation des résultats obtenus par Docteur YAHIAOUI que nous avons présenté sous forme de figures dans la partie résultats.
Au vu des manipulations que nous avons réalisées, il conviendra pour améliorer davantage les résultats des tests PCR basés sur la recherche de gènes par : i) rechercher des amorces plus adaptées à la détection de ces gènes pour éviter les amplifications aspécifiques ; ii) améliorer le programme d'amplification en augmentant par exemple le temps d'élongation, ce qui permettra l'amplification des segments les plus longs tels que ceux du gène fimH, ou bien augmenter la température d’hybridation pour empêcher les amorces de s’hybrider en dehors de la cible; iii) réduire davantage le coût de l'analyse par PCR et augmenter sa sensibilité, il serait donc important d'envisager la réduction du volume du mélange réactionnel.
Nos résultats de la recherche des gènes fimH et sfaS par PCR simplex et ceux recherchés par PCR multiplex fimH, papA et kpsMTII, ont montré leur présence parmi nos souches. Ce résultat a été confirmé par l’absence de ces gènes chez la souche de référence utilisée, qui est dépourvue de ces gènes et par leur présence chez la souche de référence, utilisée comme témoin positif de PCR.
La PCR pour l'amplification des gènes, a le potentiel pour le diagnostic rapide des infections à E. coli. Nos résultats corroborent les perspectives du diagnostic rapide des infections à E. coli par la méthode PCR. Bien qu’un certain nombre de méthodes classique ont été élaboré pour l’identification des E. coli pathogènes, l’utilisation de la PCR est la seule qui donne des résultats cohérents.
Malgré que La technique d’extraction a été simple pour caractériser génétiquement les produits d’amplification, en perspectives de ce travail, il serait intéressant de pouvoir approfondir notre travail en améliorant encore plus la technique d’extraction allant à la purification de l’ADN pour pouvoir séquencer ces gènes, on travaillant avec des produits moins dangereux comme le cyber green au lieu du BET pour rendre accessible aux personnels manipulateurs.
Description
Keywords
les gènes, PCR, électrophorèse