Le portail NCBI : base de données bioinformatique clé en biotechnologies
| dc.contributor.author | BOUADJILA, Latifa. TALEB, Zineb | |
| dc.date.accessioned | 2019-07-03T08:07:28Z | |
| dc.date.available | 2019-07-03T08:07:28Z | |
| dc.date.issued | 2019 | |
| dc.description.abstract | Le portail NCBI (National Center for Biotechnology Information) occupe une placeprimordiale parmi les multitudes de banques de données généralistes et spécialisées connues. Il offre une grande quantité d’informations sur les génomes, les protéines et les références bibliographiques. Ainsi, il offre des outils divers qui facilitent l’ajout, la mise à jour et la recherche des données. L’objectif de ce travail était d’explorer le portail NCBI, afin de caractériser et cribler des mutations géniques chez E. coli. Nos résultats de la recherche de mutations dans le gène aac-(6’) -Ib en utilisant les outils de traduction, de nettoyage de séquences, d’alignement simple et multiple et de BLAST, ont montré pour les deux souches d’E. coli étudiées la présence de deux mutations (Trp (w) 102 Arg (R)) et (Asp (D) 179 Tyr(Y)) responsables de la résistance aux quinolones. Concernant la caractérisation de l’allèle du gène CTX-M par une approche de formation d’omplicon et de BLAST, nous avons décrit la présence du variant alléliqueCTX-M15qui correspond au variant qui circule parmi les souches d’E.coli résistantes aux antibiotiques en Algérie. L’analyse de séquences par les divers moyens offerts dans les milliers de bases de données, permet de s’informer sur les caractéristiques fonctionnelles, structurales et évolutives d’une protéine. | en_US |
| dc.identifier.uri | http://dspace.univ-msila.dz:8080//xmlui/handle/123456789/14545 | |
| dc.language.iso | fr | en_US |
| dc.publisher | Université Mohamed BOUDIAF de M'Sila | en_US |
| dc.subject | Le portail NCBI, biotechnologies | en_US |
| dc.title | Le portail NCBI : base de données bioinformatique clé en biotechnologies | en_US |
| dc.type | Thesis | en_US |